在红叶村成功破坏黑衣组织的一处仪式场地后，柯南等人与国际刑警组织紧密合作，争分夺秒地在全球范围内排查黑衣组织可能设立的其他仪式地点。国际刑警组织利用其庞大的情报网络，对世界各地上报的异常情况进行汇总分析，柯南、灰原哀和阿笠博士则凭借着对黑衣组织的了解，协助国际刑警解读线索，寻找隐藏在其中的关键信息。
“根据目前收集到的信息，黑衣组织似乎偏好选择一些具有特殊地理和历史背景的地点设立仪式场地。”柯南看着满墙的地图和资料说道，上面标记着全球各地可能与黑衣组织仪式相关的地点。
“没错，而且从他们之前的行动来看，这些地点往往伴随着一些神秘传说或超自然现象的记载。”灰原哀补充道，她正仔细翻阅着一本关于世界各地神秘事件的书籍。
阿笠博士在一旁操作着电脑，将新得到的数据录入分析系统：“孩子们，我把所有符合条件的地点进行了筛选和排序，按照可能性高低，我们可以逐个排查。”
此时，国际刑警组织传来消息，在南美洲的一片古老丛林中，发现了一些奇怪的建筑遗迹，其建筑风格与之前在红叶村仪式场地看到的有相似之处，周边还时常出现一些当地居民无法解释的奇异光芒。柯南等人立刻意识到，这极有可能是黑衣组织的另一个仪式场地。
柯南、灰原哀与几位国际刑警组织的精英成员组成特别行动小组，迅速乘坐专机前往南美洲。经过长时间的飞行，他们抵达了丛林边缘的小镇。在当地向导的带领下，特别行动小组深入丛林。
丛林中植被茂密，藤蔓交织，行进十分困难。而且，他们还要时刻警惕可能隐藏在暗处的危险。经过几天的艰难跋涉，他们终于找到了那片神秘的建筑遗迹。
遗迹中矗立着几座巨大的石制金字塔，塔身刻满了与黑衣组织符号相似的图案。在金字塔之间，有一个巨大的圆形广场，广场中央是一个深不见底的黑洞，周围摆放着一些散发着诡异光芒的水晶。
“这里的布置和红叶村的仪式场地很相似，看来我们找对地方了。”柯南低声说道，同时示意众人保持警惕。
就在他们准备进一步深入调查时，突然听到一阵低沉的嗡嗡声，从黑洞中缓缓升起一个巨大的金属装置。装置表面闪烁着幽蓝的电光，周围的空气仿佛都被扭曲。
“不好，他们已经启动了部分装置。”灰原哀脸色一变。与此同时，一群黑衣组织成员从遗迹的各个角落涌出，将特别行动小组团团包围。
“你们这些碍事的家伙，竟然又跟到了这里。不过，你们以为这次还能阻止我们吗？”一个黑衣组织头目冷笑着从金字塔后走出。
柯南看着眼前的敌人，毫不退缩：“你们的恶行不会得逞的，今天就是你们阴谋终结的地方。”
战斗瞬间爆发，国际刑警组织的成员们训练有素，迅速与黑衣组织成员展开交火。柯南和灰原哀则趁着混乱，朝着那个巨大的金属装置靠近。他们知道，只有破坏这个装置，才能阻止黑衣组织在这里的仪式。
在激烈的枪林弹雨中，柯南发现黑衣组织成员似乎在守护着一条通往装置核心的通道。他和灰原哀相互配合，利用周围的巨石和石柱作为掩护，巧妙地躲避着敌人的攻击，逐渐接近通道入口。
就在他们快要到达通道入口时，一枚炸弹在他们附近爆炸，强大的冲击力将柯南和灰原哀掀翻在地。“柯南！”灰原哀艰难地从地上爬起来，呼唤着柯南。
“我没事，继续前进！”柯南咬着牙，忍着身上的疼痛，拉着灰原哀继续朝着通道冲去。终于，他们突破了敌人的防线，进入了通道。
通道内部光线昏暗，两侧的墙壁上刻满了神秘的符文，似乎在诉说着古老的秘密。沿着通道深入，他们来到了一个巨大的石室，石室中央放置着一个散发着强烈光芒的能量核心，这就是整个装置的关键所在。
然而，就在他们准备动手破坏能量核心时，石室的大门突然关闭，从墙壁中涌出一群机械守卫。这些机械守卫身形高大，装备着各种武器，向柯南和灰原哀发起攻击。
“这些机械守卫很难对付，我们得想办法找到它们的弱点。”柯南一边躲避着机械守卫的攻击，一边观察着它们的行动模式。
灰原哀在一旁仔细观察，发现机械守卫的关节部位在攻击时会露出一些细微的破绽。“柯南，攻击它们的关节，那里可能是弱点！”灰原哀喊道。
柯南立刻会意，他捡起地上的一块尖锐石头，朝着一个机械守卫的关节部位扔去。石头准确地击中了关节，机械守卫的行动顿时变得迟缓起来。灰原哀趁机拿出随身携带的小型激光切割器，对着机械守卫的关节进行切割。
在柯南和灰原哀的努力下，一个又一个机械守卫被破坏。最终，他们成功来到了能量核心前。柯南拿出特制的破坏工具，准备对能量核心进行破坏。
就在这时，能量核心突然发出一阵强烈的光芒，将柯南和灰原哀笼罩其中。光芒中，出现了一个神秘的身影。
“你们以为可以轻易破坏这里吗？太天真了。这是黑衣组织的伟大计划，你们无法阻挡。”神秘身影的声音回荡在石室中。
“不管你是谁，我们都不会让黑衣组织的阴谋得逞。”柯南坚定地说道。
神秘身影冷笑一声：“那就让你们见识一下这股力量的厉害。”说完，能量核心的光芒变得更加强烈，石室开始剧烈摇晃，仿佛即将坍塌。
柯南和灰原哀能否在这千钧一发之际破坏能量核心，阻止黑衣组织在南美洲的仪式？而在全球其他地方，是否还有更多的仪式场地等待他们去发现和破坏？随着月圆之夜的日益临近，与黑衣组织的终极对决即将到来，柯南和他的伙伴们面临着前所未有的巨大压力，但他们的信念如同钢铁般坚定，誓要为世界的和平与安宁奋战到底......