柯南等人站在警局那略显昏暗的房间里，周围的空气仿佛都因那份加密文件的内容而变得沉重压抑。刚刚破解出的黑衣组织备用计划，如同一团阴云，沉甸甸地压在每个人心头。
“根据文件里提到的一些模糊信息，我们首先要确定可能的地点范围。黑衣组织选择研发基地的地点肯定极为隐秘，而且要有足够的资源和条件来支持病毒的研发。”柯南打破了沉默，他一边说着，一边在桌上铺开一张世界地图，用红色标记笔在上面圈出几个区域。
“从以往他们的行动模式来看，这些地区要么有着先进且不易被察觉的科研设施，要么有着复杂的地理环境便于隐藏。”灰原哀凑近地图，指着柯南圈出的区域说道，“像这片位于东欧的山区，有着许多废弃的军事基地，很适合进行秘密研究。还有东南亚的这片热带雨林，地形复杂，人迹罕至，也具备隐藏大型研发基地的条件。”
神秘人微微点头，补充道：“另外，在非洲的一些沙漠腹地，同样有可能。那里广袤无垠，监控困难，黑衣组织可以在不被发现的情况下开展他们的邪恶计划。”
众人商议后，决定兵分几路，同时对这些可疑区域展开调查。柯南、灰原哀和神秘人一组，前往东欧山区；毛利小五郎带领少年侦探团与部分警方人员，前往东南亚热带雨林；而国际刑警组织则负责协调各方资源，并对非洲沙漠地区进行排查。
柯南一行人乘坐飞机抵达东欧山区附近的小镇。这里山峦起伏，连绵不绝，远处的山峰在云雾中若隐若现，给人一种神秘而冷峻的感觉。他们在小镇上找到了一位熟悉当地地形的向导。向导是一位头发花白但精神矍铄的老人，他对这片山区的每一条小路、每一个废弃设施都了如指掌。
“这片山区以前是军事要地，冷战时期修建了许多军事基地。后来大部分都废弃了，但也有一些被不法分子利用，做着见不得人的勾当。”老人一边带着众人朝山区进发，一边介绍着情况。
进入山区后，四周愈发寂静，只有众人踩在落叶上发出的沙沙声。柯南时刻保持警惕，留意着周围的任何异常迹象。突然，灰原哀拉住柯南的衣角，轻声说：“柯南，你有没有闻到一股淡淡的化学药剂味？这味道很像是病毒研发过程中可能会用到的试剂。”
柯南嗅了嗅空气，果然捕捉到了那一丝不易察觉的气味。“看来我们找对地方了，大家小心，黑衣组织很可能就在附近。”他低声提醒道。
众人顺着气味的方向小心翼翼地前行，在一片茂密的树林后，隐约看到了一座废弃的军事基地。基地的大门紧闭，周围的围墙爬满了青苔，看起来荒废已久。但仔细观察，却能发现围墙顶部新装了一些先进的监控设备。
“这地方看似废弃，实则戒备森严。我们要想进去，得先解决这些监控。”神秘人轻声说道。他手中法杖一挥，一道无形的能量波悄然传出，瞬间干扰了监控设备的信号。
“快走，趁他们还没发现监控异常。”柯南一挥手，众人迅速朝着基地大门靠近。然而，就在他们接近大门时，地面突然震动起来，从地下升起一排尖锐的钢刺。
“小心！”柯南大喊一声，众人连忙后退躲避。“看来他们在这里设了不少陷阱。我们得更加谨慎。”
与此同时，毛利小五郎带领的队伍在东南亚热带雨林中也遇到了麻烦。雨林中闷热潮湿，蚊虫肆虐，行进十分困难。而且，他们似乎被一股神秘的力量跟踪着。
“叔叔，我总觉得有人在盯着我们。”步美紧张地拉住毛利小五郎的衣角。
“别害怕，步美。大家保持警惕，随时准备应对突发情况。”毛利小五郎安慰着步美，同时握紧了手中的武器。
突然，一群身着黑衣的人从周围的树林中窜出，将他们团团围住。这些人脸上戴着黑色面罩，只露出一双双冰冷的眼睛。
“你们是谁？为什么跟踪我们？”毛利小五郎大声质问道。
“哼，你们不该来这里的。既然来了，就别想活着离开。”为首的黑衣人冷冷地说道。
双方剑拔弩张，一场恶战一触即发。毛利小五郎示意少年侦探团躲在身后，自己则与警方人员摆开架势，准备迎敌。
而在非洲沙漠地区，国际刑警组织的搜索行动同样困难重重。茫茫沙漠，烈日高悬，沙浪滚滚，每前进一步都要付出巨大的体力。而且，沙漠中环境复杂，各种极端天气随时可能出现。
“报告，在前方发现一些奇怪的脚印，不像是普通行人的。”一名刑警队员通过对讲机汇报。
“继续追踪，看看这些脚印通向哪里。注意安全，随时保持联系。”行动负责人回复道。
柯南这边，他们在躲过钢刺陷阱后，继续寻找进入基地的方法。神秘人用法杖探测周围的能量波动，发现基地的一侧有一条隐藏的地下通道。
“这里有一条通道，可能通向基地内部。但我们不知道里面有什么等着我们。”神秘人说道。
“不管里面有什么，我们都要进去。黑衣组织的病毒研发不能再继续下去了。”柯南坚定地说道。
众人沿着地下通道缓缓前行，通道内阴暗潮湿，弥漫着一股腐臭的味道。走了一段距离后，前方出现了一扇巨大的金属门。门上刻着一些奇怪的符号，与黑衣组织之前的标志有相似之处。
“这扇门看起来很重要，也许后面就是病毒研发的核心区域。”灰原哀说道。
柯南仔细观察着门上的符号，试图找出打开门的方法。就在这时，通道里突然传来一阵沉重的脚步声，似乎有什么东西正朝着他们走来……柯南等人能否顺利打开这扇金属门，阻止黑衣组织的病毒研发？毛利小五郎他们又能否突破黑衣人的包围？国际刑警组织在沙漠中的追踪是否能找到关键线索？一切都充满了未知与危险，柯南和他的伙伴们正一步步深入危机的核心，与黑衣组织展开一场生死时速的较量......