星链星域的时空封印塔平稳运行了三个月，晶核碎片的能量波动始终稳定，暗物质能量被彻底压制在封印层下。银溪带领的新守护者小队负责日常巡逻，每日都会对封印塔的符文能量、晶核状态进行三次全面检测，从未出现过异常。
直到这天凌晨，封印塔的底层突然传来低频震动，监测仪上的暗物质能量曲线瞬间飙升，原本透明的封印层竟浮现出黑色纹路，与之前晶核碎片上的暗物质印记如出一辙。“不好！封印层在被暗物质能量侵蚀！”银溪立刻启动紧急预案，让小队成员加固符文阵，自己则驾驶机甲冲向底层，查看具体情况。
抵达底层时，银溪瞳孔骤缩——封印塔的地基处裂开一道深不见底的缝隙，黑色的暗物质能量从缝隙中喷涌而出，正不断腐蚀着封印晶核碎片的能量罩。更可怕的是，缝隙中传来一阵低沉的“召唤声”，透过机甲的通讯器传入耳中，仿佛来自宇宙诞生之初的低语，让人心神不宁。
“队长！封印塔底层出现暗物质能量泄漏，缝隙中存在强烈的能量源，疑似‘暗物质本源’！”银溪的声音带着颤抖，她试图用三源能量修复缝隙，却发现暗物质能量能直接吞噬三源能量，修复毫无效果。
云航接到消息时，正在星尘之源与三域科学家研究宇宙屏障的长期防护方案。“流火号”立刻全速起航，机甲精英小队、星垣与里昂也第一时间集结，朝着星链星域疾驰。途中，星垣通过古籍快速翻阅相关记载，脸色愈发凝重：“暗物质本源是暗物质世界的核心能量体，它能召唤所有暗物质生物，一旦被它突破封印，整个宇宙的暗物质都会被激活，到时候连宇宙屏障都会被暗物质吞噬！”
舰队抵达封印塔时，底层的缝隙已扩大到数十米宽，暗物质能量形成一道黑色光柱，直冲星空。封印层的能量罩濒临破碎，晶核碎片的光芒忽明忽暗，随时可能被暗物质能量彻底污染。“机甲小队分成两组！一组用三源融合能量压制暗物质光柱，一组随我潜入缝隙，找到暗物质本源，用晶核碎片的时空能量封印它！”云航的“星陨”机甲率先弹射而出，高频刃注入三源能量，朝着光柱劈下。
金色、青色与银色的光刃击中光柱，黑色能量剧烈翻滚，光柱暂时矮了半截。阿凯的“狂岩”小队趁机展开巨型能量盾，将光柱牢牢压制在封印塔内；里昂的银纹机甲则带着新守护者，在封印塔周围布置临时符文阵，防止暗物质能量扩散。
云航带领精英小队潜入缝隙，缝隙内部是一片漆黑的暗物质空间，周围漂浮着无数暗物质碎片，每一块碎片都散发着能撕裂机甲的能量。越往深处，召唤声越清晰，最终在空间中心，他们看到了暗物质本源——一颗通体漆黑的球体，周围环绕着扭曲的暗物质能量，正是它在不断召唤暗物质生物。
“就是现在！用晶核碎片的时空能量攻击它的核心！”云航取出备用的晶核碎片，注入三源能量后，朝着本源掷去。碎片在半空中爆发出透明光芒，形成一道时空封印阵，将本源暂时困在其中。可本源释放出强烈的暗物质冲击波，封印阵的光芒瞬间黯淡，碎片也出现了裂纹。
“所有人将能量注入碎片！强化封印阵！”云航的“星陨”机甲率先释放全部能量，精英小队的机甲也纷纷响应，金色、青色与银色的能量源源不断地涌入碎片。封印阵的光芒重新暴涨，透明的时空能量逐渐渗透进本源内部，压制住暗物质能量的躁动。
就在封印即将完成时，本源突然分裂出一道暗物质触手，直刺云航的机甲。“小心！”里昂的银纹机甲立刻挡在云航身前，触手穿透机甲的护盾，刺入驾驶舱。里昂闷哼一声，却仍咬牙将最后一丝能量注入碎片：“别管我...完成封印...”
云航红着眼眶，将全部能量注入高频刃，斩断暗物质触手，同时将能量全部灌入碎片。封印阵彻底激活，透明的时空能量将本源包裹，逐渐将其压缩、封印。随着本源被封印，缝隙中的暗物质能量快速消散，封印塔的震动也随之停止。
当云航带着小队与受伤的里昂返回地面时，封印塔的封印层已恢复稳定，暗物质能量被彻底压制。三域的科学家立刻对里昂进行救治，银溪则带领新守护者，对封印塔进行全面加固，在地基周围布置了三重时空符文阵，确保暗物质本源不会再次异动。
一周后，里昂从昏迷中醒来，虽然身体还需恢复，但已无生命危险。云航站在病房外，望着星链星域的星空，心中满是坚定。经历了暗物质本源的危机，三域联盟对宇宙危险的认知更加深刻，也更加明白团结的重要性。