突破黑牙前哨站后，远征舰队沿着暗域核心的唯一航道继续深入。航道两侧的星体表面覆盖着暗紫色的能量结晶，空气中弥漫着压抑的暗域能量，星核探测仪的警报声此起彼伏，显示周边空间极不稳定，随时可能发生坍塌。
航行至第三天，前方空域突然开阔——一颗通体漆黑的行星悬浮在宇宙中，表面布满巨大的能量纹路，无数暗域战舰围绕行星排列，形成多层防御圈，这便是暗域的核心基地“死寂之星”。行星顶端，一座巨型能量塔正不断向周边战舰输送能量，塔尖闪烁的暗紫色光芒，与此前暗域母舰的湮灭主炮如出一辙。
“那是暗域的‘本源能量塔’，所有战舰的能量都来自这里，必须先摧毁它！”陈教授的声音带着急切，“但能量塔周围有三艘‘暗域领主舰’守护，它们的护盾强度是之前母舰的三倍，普通攻击根本无效。”
云航盯着屏幕，发现领主舰的纹路中流淌的能量存在间隙——每小时会有十分钟能量回流，此时护盾强度会大幅降低。“等待能量回流窗口期，‘核心圈’星核级战舰用破域炮集中攻击领主舰，机甲小队趁机突入能量塔，摧毁核心装置！”
一小时后，探测仪显示领主舰的能量开始回流，护盾光芒明显减弱。“开火！”云航一声令下，十艘星核级战舰的破域炮同时轰鸣，银蓝色的能量束如利剑般射向领主舰。“轰！轰！轰！”三艘领主舰的护盾同时出现裂痕，舰体被破域炮击中，冒出黑烟。
“机甲小队出击！”云航驾驶“星痕”带头冲出舰队，三百架星锐机甲紧随其后，如银色洪流般冲向能量塔。暗域黑甲机甲蜂拥而至，试图阻拦，星陨刃与黑甲的能量刀碰撞，火花在虚空中四溅。“星痕”的星核探测臂锁定黑甲的能源核心，星陨刃释放冲击波，瞬间清空一片黑甲。
但能量塔周围的暗域战舰不断释放能量炮，星锐机甲的护盾接连破碎，数架机甲被击中，化为宇宙中的残骸。“为了联盟！冲！”云航嘶吼着，操控“星痕”突破火力网，率先抵达能量塔底部。塔壁上的暗紫色纹路突然活过来，化作能量触手，缠住“星痕”的四肢，试图将机甲拖入塔内。
“星痕”启动星核过载，星陨刃爆发出强光，斩断能量触手，同时对着塔壁的薄弱点连续劈砍，硬生生开辟出一个入口。机甲小队紧随其后，进入能量塔内部。塔内布满能量流，暗域士兵手持能量枪，对着小队疯狂扫射。
云航带领小队一路突破，终于抵达能量塔的核心控制室——一颗直径十米的暗紫色晶体悬浮在中央，正是本源能量的源头。“摧毁它！”云航举起星陨刃，全力劈向晶体。晶体突然释放出一道能量波，将机甲小队震飞，“星痕”的装甲出现裂痕，能源核心受损严重。
此时，暗域的最高指挥官“暗蚀领主”驾驶着巨型机甲，从阴影中走出，机甲手持一把暗紫色的长柄斧，斧刃能吸收能量流，对着“星痕”劈来。“联盟的蝼蚁，竟敢破坏我的计划！”暗蚀领主的声音带着冰冷的杀意。
“星痕”迅速举刀格挡，长柄斧的力量震得云航手臂发麻，机甲被震退数米。暗蚀领主趁机发起猛攻，长柄斧不断劈砍，“星痕”的护盾逐渐破碎。云航看着身后的本源晶体，突然有了主意——他故意露出破绽，引诱暗蚀领主挥斧砍来，随后启动推进器，侧身避开，长柄斧正中本源晶体。
“不！”暗蚀领主惊呼。晶体被击中的瞬间，能量开始紊乱，整个能量塔剧烈震颤。云航抓住机会，操控“星痕”举起星陨刃，对着暗蚀领主机甲的能源核心全力劈下。“轰！”暗蚀领主的机甲爆炸，本源晶体也随之碎裂。
能量塔失去能量供给，开始崩塌，暗域战舰的护盾纷纷消失，联盟舰队趁机发起总攻，暗域战舰接连爆炸。云航驾驶着破损的“星痕”，从崩塌的能量塔中冲出，看着暗域核心基地逐渐化为废墟，露出了疲惫的笑容。
远征舰队的欢呼声在通讯频道中响起，暗域的威胁终于被彻底清除。