三界“整风运动”愈演愈烈，稽查之网遍布四洲，此前潜藏的乱象一一浮出水面，桩桩件件皆触目惊心。
西牛贺洲一处名为“玄慈寺”的寺院，素来以“慈悲济世”为名，对外宣称收养孤儿、救济贫弱，实则暗地修炼邪法——寺中僧人将收养的孩童囚于地牢，抽取其精血炼制“童魂丹”，妄图借此提升修为；更有甚者私藏被劫掠的妇人，日夜凌辱，手段残忍至极。
此事被当地山神察觉，连夜奏报至斗部。武曲星君关羽闻讯，怒不可遏，当即率领天兵直奔玄慈寺。踏入寺院的那一刻，关羽银髯倒竖，凤眼圆睁，手中青龙偃月刀寒光暴涨。“尔等秃驴，假慈悲之名行恶事，亵渎佛法，罪该万死！”
话音未落，关羽挥刀便斩——刀光过处，寺中僧人无一生还，肉身皆被劈成两半。他并未罢休，又召来阴差，将僧人的神魂勾出，厉声喝道：“此等恶徒，不配入轮回！将其打入无间地狱，永世受烈焰焚烧之苦，不得超生！”
阴差领命，押着僧魂离去，玄慈寺的地牢被彻底捣毁，孩童与妇人皆被救出，交由人间官府安置，寺院则被一把大火焚毁，以儆效尤。
东胜神洲亦有乱象——某座山神庙的山神，竟以“降灾”相要挟，逼迫山下百姓每日供奉牛羊、金银，若有怠慢，便引山洪、召瘟疫，害得百姓流离失所。
东岳帝君得知此事后，亲自降临山神庙，当着百姓的面，以“滥用神职、欺压众生”为由，剥夺山神的神位，收回其神通，将其贬至星空深处险恶之地，永世劳作，不得返回。
这场整风运动的稽查结果，不仅让三界神佛震撼于泰玄的狠辣与严酷，更触动了太上老君。随着道家势力日渐兴盛，难免泥沙俱下，混入投机取巧之辈——老君虽崇尚“无为而治”，却也知晓此时若不加以规整，道家根基恐会动摇。
于是，他决定再次下凡，寻觅有缘之人，建立正统道统，规范修行之法。
老君化身一位白发老者，云游至蜀中，恰逢张道陵在青城山修行。张道陵自幼好道，心怀慈悲，曾散尽家财救济百姓，道心坚定。
老君见他根器深厚，便将《道德经》真义、炼丹之术与驱邪法门倾囊相授，收他为弟子，命他建立“正一道”，确立“授箓”体系——凡入道者，需经考核，授以符箓，明确修行方向与戒律，杜绝滥竽充数之辈。
张道陵不负老君所托，在蜀中扫灭为祸一方的鬼王，收服无数作乱的精怪，百姓皆称之为“张天师”。后来，他前往龙虎山建立道统，广收弟子，传授道法，使正一道成为道家重要流派。
待张道陵修行圆满、飞升天庭后，玉帝感念其功绩，封他为“天师”，掌太玄都省事，统辖天下道教事务；跟随他扫灭鬼王的护法神将赵公明（注一），因功被封为“龙虎玄坛真君”，掌管护法之事。
时光荏苒，数百年光阴转瞬即逝。三界整风运动虽让仙道风气为之一新，人间却因汉王朝没落，陷入分崩离析之局——中原大地战火纷飞，诸侯割据，百姓流离失所，杀劫的阴霾日益浓重。武曲星君关羽见此情景，心中不忍，主动请命真身转劫人间，誓要护佑汉家正统。
玉帝准奏，关羽褪去神位，投入轮回，转世为解良县关氏之子，虽无前世记忆，却天生神力，勇武过人。
转世后的关羽，在涿郡与刘备、张飞相遇，三人志同道合，于桃园结义，立誓“上报国家，下安黎庶”。泰玄深知此世杀劫凶险，仅靠关羽一人难以支撑，便又命赵公明、温琼、雷部辛元帅、张元帅先后下凡，辅佐刘备。
为助刘备稳固根基，泰玄更是亲自化身一位世外高人，隐居于隆中，将治国理政之策、奇门遁甲之术与排兵布阵之法传授于诸葛孔明。
在诸葛亮的辅佐下，刘备麾下人才济济，先是联合孙权在赤壁大败曹操，后又夺取荆州、益州、扬州，逐步建立起稳固的基业，最终灭了江东孙吴政权，割据江南，虽未能一统中原，却成功保住了南方半壁江山，让汉家正统得以延续。
中原杀劫爆发时，北方陷入前所未有的战乱，生灵十不存一，而南方因刘备政权的庇护，百姓得以安居乐业，炎黄元气得以保留。
待天下局势稍定，刘备、诸葛亮等人皆已寿终正寝。玉帝感念他们护佑人间、延续正统的功绩，下旨将几人魂魄召至天庭，论功封神。
诸葛孔明因智谋超群、治国安邦有功，被封为“天枢神相”，与张良同掌天枢院都省，兼“九天护道扬法雷神”，负责辅佐玉帝处理三界政务，兼管护持道法、惩治邪祟之事。
刘备心怀天下、仁德爱民，被封为“北河侯”，归属水官洞阴帝君麾下，主掌阴司积案、冤案，为受冤之人昭雪；张飞性情耿直、勇猛过人，被封为“阴阳两界大巡查使”，专管阴阳两界的不平之事，凡有欺压众生、滥用职权者，皆可由他稽查处置。
赵云与马超因战功赫赫，分别被封为“辅天翊圣顺平大将军”与“辅天翊圣神威大将军”，轮流镇守凌霄宝殿宫门，护卫天庭安全；黄忠素来仰慕执法真官大羿，且一生刚正不阿，便被任命为司非府执法真官，缉拿乱法之辈。
关羽本就是武曲星君，此次转劫人间功绩卓着，玉帝特封他为“崇宁真君”，兼任斗部大元帅，执掌斗部兵马，统天兵，护持天庭安危。
赵公明转世后，在刘备麾下担任运粮总管，始终护持粮道畅通，且粮草分毫不差，后来又辅佐诸葛亮分管税务，理财能力出众，玉帝便加封他为“财部大元帅”，兼管守护人间财产安全，成为百姓口中的“财神”之一。
温琼因多次率军平定叛乱、护佑百姓，被加封为“三山五岳大元帅”，统管三山五岳的神兵，更赐“无拘霄汉”金牌，可随时面见玉帝，无需通报。
雷部辛元帅、张元帅也因辅佐刘备立下战功，各有赏赐——辛元帅加封为“雷部副元帅”，协助九天应元雷声普化天尊掌管雷部事务；张元帅则被封为“雷部执法先锋”，专司巡查三界，惩治作恶的妖邪与乱法的修士。
凌霄宝殿金光缭绕，仙乐阵阵。刘备、诸葛亮、关羽等人身着崭新的官服，依次上前叩谢玉帝恩典。玉帝看着眼前的众仙，温和道：“尔等生前护佑人间，此后亦当护持三界。望尔等恪尽职守，不负朕之所托，不负众生之望。”众仙齐声应诺，声音震彻云霄。